首个草鱼肠道微生物基因目录构建

1月10日，记者从中国农业科学院获悉，该院饲料研究所水产微生物与饲料创新团队成功构建了首个草鱼肠道微生物基因目录。该成果日前发表于国际期刊《微生物组》。

肠道菌群在鱼类的新陈代谢过程和免疫系统运作中扮演着关键角色，但目前对于鱼类肠道微生物基因组的认知仍然相当有限。

“研究团队运用了宏基因组学技术，成功构建了包含57.6万个基因的非冗余草鱼肠道微生物基因目录，并对这些基因进行了详尽分类与功能注解。这一成果为我们深入理解鱼类肠道微生物的复杂生态系统提供了工具。”论文共同通讯作者、中国农业科学院饲料研究所研究员周志刚告诉科技日报记者。

草鱼的微生物基因目录注释和肠道微生物群的结构及功能特征。

研究进一步解析了草鱼肠道微生物组的主要互作模式和功能特征。“我们发现草鱼肠道微生物存在两个功能群。这两个功能群在生态学上呈互斥模式，并且在碳水化合物利用、毒力因子和抗生素耐药性基因等方面均表现出显著的遗传能力差异。进一步研究发现，两个功能群之间的比值能够有效地反映出草鱼在不同饮食条件下的肠道微生物群落的构成和功能特性。因此，这一比值可以作为一个指标，用于评估鱼类肠道菌群的稳定性状态。”周志刚说。

该研究扩充了鱼类肠道微生物的基因目录资源，揭示了鱼类肠道菌群主要门类的功能特征，为肠道菌群的调控提供了潜在的靶点。“我们所构建的基因目录为深入研究草鱼肠道微生物组提供了基因资源。通过多种组学分析，我们能够更全面地理解鱼类微生物群中的主要门类所扮演的角色，进而发现调控这些微生物群的关键靶点。”周志刚说。

（中国农业科学院供图）